Øjenfarve, klolængde og skalform er nogle få indikatorer
Det er ofte svært at bestemme køn af en kæleskildpadde, især hvis du ikke har købt den fra en opdrætter, der udklækkede dem fra kontrollerede temperaturmiljøer. Temperaturen under ægudrugningen er det, der afgør, om et embryo bliver en han eller hun; køligere inkubationstemperaturer producerer hanner og hunner udvikler sig i varmere temperaturer.
Heldigvis er der nogle typer skildpadder, der gør det nemmere end andre at skelne en han fra en hun uden at kende deres inkubationstemperatur. Rødørede skydere viser for eksempel seksuel dimorfi og har tydelige forskelle i størrelse og udseende mellem kønnene.
Brug af skalstørrelse og -form til at bestemme køn
Størrelsesforskellene mellem de fleste han- og hunskildpadder er måske ikke tydelige, før skildpadderne bliver kønsmodne (og kosten kan også spille en rolle for størrelsen af en skildpadde). Til mandlige rødørede skydere, seksuel modenhed handler om det tidspunkt, de når 10 centimeter i længden (og omkring to til fem år gamle). Hunnerne er kønsmodne, når de når 6 til 18 centimeter lange (hvilket kan tage fem til syv år). Hunnerne vil vokse sig større end hannerne i rødørede skydere og mange andre skildpaddearter, men størrelsesforskellen mellem hanner og hunner varierer fra art til art. For eksempel kan hunnerne hos sulcata-skildpadder nå 45 kg, og hannerne kan blive 91 kg eller mere. Hos havskildpadder kan både hannen og hunnerne vokse til samme størrelse. For pålideligt at bruge skalstørrelse som en faktor til at bestemme køn af en skildpadde, skal skildpadden have nået sin voksne størrelse.
Bunden af en skildpaddes skal (kaldet plastron) bruges også som en indikator til bestemmelse af køn hos skildpadder. Hanskildpadder har en konkav (buet) plastron, mens hunnerne har en flad. Disse former gør det muligt for hanskildpadder lettere at montere en hun under parring, og de giver hunnerne mere plads til at holde æg internt.
Brug af kloængde til at bestemme køn
Hunskildpadder har ofte kløer på deres forfødder, der er korte og stubbe. Hanner (og specifikt rødørede skydere og andre vandskildpadder) har meget længere kløer på deres forfødder end hunner. Dette skyldes, at hannerne bruger deres kløer, når de forsøger at bejle til hunner for at yngle. Under parringen vil hannerne også tage fat i hunnens øverste skaller ved at bruge deres lange kløer.
Brug af haler til at bestemme køn
Den mest almindelige måde at bestemme køn hos en skildpadde er at se på halens længde. Hunskildpadder har korte og tynde haler, mens hannerne har lange, tykke haler med deres udluftning (cloaca) placeret tættere på enden af halen sammenlignet med en hun. Det er selvfølgelig nemmest at bestemme kønnet på en skildpadde, når man ser på dens halelængde, hvis man har flere skildpadder af begge køn at sammenligne.
Brug af markeringer og farve til at bestemme køn
Alle skydere med røde øre har overvejende grønne kroppe fyldt med lyse gule striber, som ikke hjælper med at skelne hanner fra hunner. Men andre farveindikatorer kan evt. Plastronen er gul med ujævne, mørke aftegninger, der er parret, mens halen, benene og hovedet er grønne med tykke gule striber. Efterhånden som de rødørede skydere bliver ældre, skifter mange til en mørk, næsten sort farve og kan skjule nogle eller alle deres gule markeringer. Denne mørkere farve er mere almindelig hos mandlige rødørede skydere.
Udsmykkede boksskildpadder er en anden slags skildpadde, der er seksuelt dimorf. Modne mandlige udsmykkede skildpadder har røde øjne, mens kvindelige øjne er brune eller gule. Hannerne har også grønligt farvede hoveder med røde eller orange benskæl, og hunnerne har brune hoveder med gule benskæl.
